蛋白質(zhì)組學（Proteomics)是以蛋白質(zhì)組為研究對象，研究細胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學。最早是1994年由Marc Wikins首先提出的。蛋白質(zhì)組學本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征包括蛋白質(zhì)的表達水平，翻譯后的修飾蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生，細胞代謝等生物學過程的系統(tǒng)描述。隨著蛋白質(zhì)技術(shù)尤其是質(zhì)譜技術(shù)的快速發(fā)展，蛋白質(zhì)組學研究進入快速發(fā)展階段。蛋白質(zhì)組學方法已經(jīng)從傳統(tǒng)的免疫組織化學( IHC )染色、western blot和酶聯(lián)免疫吸附試驗( ELISA),發(fā)展到高通量的方法，如組織微陣列(TMA)、蛋白質(zhì)通路陣列和質(zhì)譜分析。這些高通量蛋白質(zhì)組學技術(shù)不僅減少了分析時間，還提高了蛋白質(zhì)組覆蓋的準確性和深度。隨著生物信息學和現(xiàn)代多分析“組學”技術(shù)的發(fā)展，蛋白質(zhì)組學在揭示疾病的分子機制，發(fā)現(xiàn)新的生物標志物方面有著巨大的前景，并可作為特定的診斷檢測、預后預測和治療目標，進一步加強個性化醫(yī)療。

Thermo Scientific Orbitrap Fusion Tribrid 質(zhì)譜儀創(chuàng)新性的三合一結(jié)構(gòu)結(jié)合了四極桿、Orbitrap和離子阱質(zhì)譜儀的優(yōu)點，對豐度極低、復雜性極高，或極難分析樣品的結(jié)構(gòu)分析更透徹，定量更準確，非常適合蛋白質(zhì)組學中復雜體系的高通量蛋白檢測，廣泛應用于蛋白組學、代謝組學和天然產(chǎn)物的鑒定等領(lǐng)域。

其中在蛋白組學的應用主要包括：

1、蛋白質(zhì)定性分析：蛋白質(zhì)序列分析，肽指紋圖譜分析等；

2、相對定量蛋白質(zhì)組學研究：血液、組織、細胞以及細菌等樣品的非標和標記定量蛋白質(zhì)組學分析；

質(zhì)譜在蛋白質(zhì)定量中起重要作用。使用同位素標簽的多重分析法被廣泛應用于蛋白質(zhì)豐度的高通量定量比較。Orbitrap Fusion Lumos Tribrid三合一質(zhì)譜儀可以執(zhí)行同量異位素標記TMT，能夠以高定量精度同時分析10個樣品。Orbitrap Fusion Lumos具有高選擇性和更高的靈敏度，可實現(xiàn)最佳性能，同時可保持對低豐度分析物定量的高重現(xiàn)性。

3、翻譯后修飾（PTM）蛋白質(zhì)組學研究：磷酸化、糖基化、甲基化、乙酰化等修飾位點的鑒定。

PTM在蛋白質(zhì)組學中起著重要的作用，調(diào)節(jié)細胞活性定位，與其他細胞分子發(fā)生相互作用，如蛋白質(zhì)、核酸、脂質(zhì)和輔因子。Orbitrap Fusion Lumos Tribrid三合一質(zhì)譜儀具有CID、HCD、ETD和EThcD等多個片段，可用于PTM分析，尤其是糖基化分析。例如，ETD和EThcD可以提供糖肽主鏈片段化的MS/MS譜圖，從而找到準確的修飾位點定位。